Em formação

BIS 2A: Biologia Introdutória (Facciotti) - Biologia


A série BIS 2 apresenta aos alunos os princípios nos quais toda a vida - dos menores e mais simples organismos às maiores comunidades - se baseia. O BIS 2A concentra-se na base celular da vida, concentrando-se nas estruturas e funções das células e nas moléculas biológicas a partir das quais são formadas, as maneiras pelas quais as células adquirem, transformam e usam energia química e os mecanismos pelos quais a informação genética é armazenado, protegido, transmitido de uma geração para outra e usado na reprodução e desenvolvimento, com o sistema imunológico servindo como um exemplo de desenvolvimento eucariótico complexo. Os alunos são solicitados a usar os princípios e informações cobertos na aula para interpretar observações históricas e atuais e para resolver problemas.


Fontes de referência: obtenha uma visão geral rápida

Fontes básicas como enciclopédias, dicionários e manuais podem ajudar a esclarecer os tópicos e conceitos abordados nas leituras do curso. A maioria das entradas incluirá links e imagens úteis, bem como termos relacionados e outras leituras.

Livros: obtenha uma visão mais profunda

Os livros (impressos e eletrônicos) fornecerão uma visão abrangente dos tópicos e conceitos do curso. Embora as leituras do curso apresentem a você tópicos e processos, os livros dedicados a esses conceitos têm espaço para examiná-los em profundidade se você quiser dar nuances à sua compreensão dos tópicos do curso.

Vídeo: Ótimo para alunos visuais

Os vídeos podem nos ajudar a aprender de forma mais rápida e eficaz do que apenas texto. O cérebro humano processa informações mais rapidamente e as retém por mais tempo quando emparelhado com visualizações. Além disso, se você gosta de repetição, assistir a um tutorial em vídeo depois de fazer as leituras pode ajudar a reforçar o que você aprendeu.

Ferramentas digitais: aplicar conceitos

Ferramentas digitais como modelos 3D, simulações e jogos podem ajudá-lo a obter um conhecimento mais profundo dos conceitos do curso por meio da interação. Essas ferramentas permitem observar e manipular os processos dos fenômenos biológicos e ajudam a visualizar os mecanismos subjacentes.

Conecte-se à Biblioteca VPN

O acesso aos recursos da biblioteca exigirá que você instale e ative nosso VPN, que permite que você faça login em nossas coleções eletrônicas baseadas em assinatura. Se você tiver alguma dúvida ou problema com a VPN da biblioteca, verifique nossa página de informações: https://www.library.ucdavis.edu/service/connect-from-off-campus/

Se você tiver alguma dúvida sobre como acessar esses recursos, gostaria de orientação para encontrar fontes adicionais, ou talvez tenha um recurso em mente que & # 8217deseja que a biblioteca obtenha para você & # 8211por favor, entre em contato com Sheena!


Títulos de projetos de práticas anteriores:

Títulos de projetos de práticas anteriores:

Ciências Agrárias e Ambientais
Segurança da água potável na comunidade de Dunde: uma avaliação da qualidade da água e dos riscos ambientais
Movimento de Candidatus Liberibacter solanacearum em tecido de tomate
Levantamento de quatro Vitivírus em videiras no Repositório Nacional de Germoplasma Clonal e no canal de introdução dos Serviços de Plantas da Fundação
Direcionando NmrA em tomate usando edição de genoma mediada por CRISPR / Cas9
Inoculação e persistência de sorovares de Salmonella enterica em alface cultivar Salinas
O efeito da reciclagem de cavacos de madeira de pomar inteiro sobre doenças causadas por Phytophthora niederhauserii em um porta-enxerto de amêndoa
Efeitos de inoculantes microbianos e farinha de grão de mostarda na eficácia da desinfestação anaeróbia de solo no manejo da murcha de Fusarium do morango, causada por Fusarium oxysporum f. sp. fragariae
Elemento transponível amarelinha afeta fenótipos em milho
Investigação de Moringa olefiera e Luffa cylindrica como biossorventes para o tratamento de água potável
Os efeitos da tolerância à 2-benzoxazolinona na colonização do milho e virulência em pinheiros
Compreendendo a formação de vasos da árvore Populus em resposta à seca
Ciências Animais e Veterinárias
O papel da gema no posicionamento dos espermatozoides em C. elegans
Utilizando o California Waterfowl Tracker para monitorar a densidade das aves aquáticas no Vale Central da Califórnia e o fator de risco que elas apresentam para as granjas comerciais
Caracterizando a co-localização de SV2A em cultura de células neuronais primárias de rato
Caracterizando a carga microbiana e a composição dos comedouros do colibri
Detecção de DNA de Bartonella em cães vadios das Filipinas
Ciências Biológicas
Mudando o mundo, uma membrana de cada vez
Impacto da mudança nas condições de vida do besouro da farinha vermelha, Tribolium confusum, em diferentes pontos durante o desenvolvimento
Um estudo da genética populacional da lombriga do guaxinim (Baylisascaris procyonis) na América do Norte usando um marcador de DNA mitocondrial, cox1
Investigando relações / interações do fogo com patógenos
Teste avançado de MDA para mosquitos Anopheles gambiae sensu lato
Avaliação da neuroinflamação e neurogênese em um modelo neonatal de infecção bacteriana entérica por E. coli enteropatogênica
Sequenciamento do mtDNA de Baylisascaris procyonis e investigação das relações filogeográficas entre as populações norte-americanas
Química e bioquímica
Significado clínico do magnésio ionizado em pacientes gravemente enfermos com queimaduras
Aspectos bioquímicos e clínicos da tiamina
Criação de células C2C12 que expressam Smad-4 para estudar a dinâmica de sinalização de proteínas morfogenéticas ósseas
A suplementação de selênio na dieta para mitigar o estresse oxidativo do SNC induzido por diquat
Estudo filogenético entre espécies de Bursaphelenchus no Novo México e na Califórnia usando o gene da oxidase 1 do citocromo C
Mecanismos moleculares de lesão lipotóxica dependentes do sexo na microvasculatura cerebral
Pesquisa Médica e Clínica
As drogas psicoterapêuticas são prescritas em excesso para o tratamento de doenças mentais?
Uma revisão da literatura sobre a metodologia de combate à resistência aos antibióticos
Clínicas móveis de saúde sexual em áreas rurais da Califórnia
Uso compatível de filtros de ar de alta eficiência para crianças com asma
Comparando métodos epidemiológicos e resultados de Coronavirida sp. SARS-CoV e MERS-CoV
A influência da menarca na qualidade de vida
Barreiras culturais para o rastreamento do câncer de mama em mulheres coreano-americanas de primeira geração: uma revisão da literatura
Uma análise sociopolítica da prevalência e dos fatores de risco de infecções diarreicas na Nicarágua
Doença de Alzheimer e seu impacto no cuidado
Policiais e risco cardiovascular
Investigar o efeito do estrogênio nos perfis inflamatórios dos linfócitos
Compreendendo as influências sócio-políticas e econômicas sobre os fatores de risco para Diabetes Mellitus tipo 2 em Bangladesh
Uso de imunoterapia para tratar doenças malignas comuns em pacientes com câncer
Qual poderia ser o impacto da competência cultural na saúde materna na Nigéria?
Barreiras sistemáticas para o acesso a serviços de saúde mental para comunidades latinas
Testando a eficácia de uma vacina contra zika em um modelo de síndrome congênita do zika macaco rhesus grávida
A duração da gravidez humana: um estudo da duração fisiológica da gestação humana entre mulheres que planejam o parto na comunidade
Otimização da craniectomia descompressiva em lesão cerebral traumática
Estudar vendedores ambulantes de comida como uma solução para sobremesas alimentares
Receptores semelhantes a NOD: novos reguladores do eixo microbiota-intestino-cérebro e neurogênese
Respostas de anticorpos do vírus Herpes Simplex 2 entre as espécies em relação ao desenvolvimento de vacinas
Os desafios da vacina contra influenza
Perspectivas da violência doméstica em mulheres refugiadas árabes e afegãs: uma revisão da literatura para o Projeto Ulysses na UC Davis School of Medicine
Comparando o risco de lesão do ligamento cruzado anterior de atletas jovens com o Landing Error Scoring System
O papel do grão-de-bico na desnutrição humana
Como as desigualdades raciais e de riqueza moldam os resultados dos cuidados com o HIV na região rural da África do Sul
Compreender a incidência e prevalência de coinfecção por Toxoplasma gondii em pacientes com HIV / AIDS e acesso a cuidados de saúde em comunidades marginalizadas nos EUA.
Impactos do encarceramento na saúde de homens afro-americanos e latinos
Os efeitos da acitretina na reativação do HIV latente
Caracterização da infecção pelo vírus da bronquite infecciosa em cultura de células traqueais primárias
Resíduos de cérebros de médicos refugiados afegãos e árabes: barreiras para a reentrada profissional no estado de CA
Análise de custo de testes genéticos em fetos com cardiopatia congênita
Imunologia do câncer
Eficácia da intervenção PartyWise e programas SBIRT para adolescentes em clínicas de planejamento familiar
Melhorar a purificação de exossomos de insuficiência cardíaca sistólica para uso clínico em prognóstico
Disparidades na prestação de cuidados de saúde neonatal e acesso em regiões desenvolvidas e subdesenvolvidas dos Camarões
Análise quantitativa e qualitativa de genes duplicados específicos de humanos e seus efeitos no desenvolvimento neurológico
Prevenção de HIV / DST em jovens na Área da Baía de São Francisco, Região da Baía Leste
Os serviços de doula atendem às necessidades emocionais da mãe durante o trabalho de parto?
Ciências Sociais e Educação
O papel do enquadramento da mensagem na mitigação de comportamentos prejudiciais por meio de rótulos de advertência: uma meta-análise

Cursos de pré-requisitos exigidos

Cursos da Divisão Inferior

  • FÍSICA DA FACULDADE (dois semestres ou dois trimestres sem necessidade de laboratório)
  • BIOLOGIA GERAL (dois semestres ou três trimestres com laboratório)
  • QUÍMICA GERAL (dois semestres ou três trimestres com laboratório)
  • QUÍMICA ORGÂNICA (dois semestres ou dois trimestres com um total de laboratório)
  • ESTATISTICAS (um semestre ou trimestre pode ser divisão inferior ou superior)

Cursos da Divisão Superior

  • BIOQUÍMICA com METABOLISMO (um semestre ou trimestre)
  • GENÉTICA (um semestre ou trimestre)

FISIOLOGIA SISTÊMICA (cursos semestrais ou semestrais de anatomia e fisiologia humana ou animal combinada são aceitos apenas se forem 1) divisão superior e 2) parte de uma sequência de dois cursos)

Para onde cumprir os pré-requisitos

Todos os cursos de pré-requisito são baseados nos cursos de graduação da UC Davis, conforme listado abaixo. Cursos equivalentes encontrados em outras instituições podem ser encontrados em nosso banco de dados de pré-requisitos, listados em ordem alfabética pelo nome da instituição. A maioria das faculdades públicas da Califórnia está listada no banco de dados, assim como algumas instituições de fora do estado.

Instituição não listada no banco de dados?

Envie um formulário de solicitação de substituição de pré-requisito para aprovação do curso. Envie um para cada um dos três cursos da divisão superior.

Os cursos obrigatórios de divisão inferior não exigem aprovação, a menos que o título ou a sequência do curso não reflitam claramente o conteúdo do curso.

Cada instituição listada no banco de dados possui um documento denominado acordo de articulação, que relaciona os cursos equivalentes oferecidos naquela universidade. Não existem acordos de articulação para Estatisticas pois aceitaremos QUALQUER curso de estatística (negócios, medicina, psicologia, etc.).

Os candidatos são responsáveis ​​por garantir que tenham feito os cursos pré-requisitos apropriados, necessários para serem admitidos no programa DVM. Use as descrições do curso conforme declarado abaixo como um guia para o que cada curso de pré-requisito deve implicar.

Cursos de graduação da UC Davis

Alunos da UC Davis são obrigados a fazer o curso ou série de cursos descritos abaixo. Nenhuma substituição será considerada. Todos os outros alunos deve primeiro revisar onde realizar os pré-requisitos. Se não houver um acordo de articulação para a instituição onde os cursos foram ou serão realizados, as descrições dos cursos abaixo devem ser usadas como um guia para encontrar cursos comparáveis.

PHY 1A, 1B ou PHY 7A, 7B, 7C *

Princípios de Física PHY 1A
Descrição: Mecânica. Introdução aos princípios gerais e métodos analíticos usados ​​na física com ênfase nas aplicações nas ciências agrícolas e biológicas aplicadas e na educação física.
Detalhes: Palestra - 3 hora (s).

Princípios de Física PHY 1B
Descrição: Continuação de PHY 001A. Calor, ótica, eletricidade, física moderna.
Detalhes: Palestra - 3 hora (s).

PHY 7A Física Geral
Descrição: Introdução aos princípios gerais e métodos analíticos usados ​​em física para alunos com especialização em ciências biológicas.
Detalhes: Palestra - 1,5 hora (s) Discussão / Laboratório - 5 hora (s).

PHY 7B Física Geral
Descrição: Continuação de PHY 007A. A Física 7B é mais parecida com o primeiro trimestre ou semestre dos cursos tradicionalmente ministrados que tratam da mecânica clássica.
Detalhes: Palestra - 1,5 hora (s) Discussão / Laboratório - 5 hora (s).

PHY 7C Física Geral *
Descrição: Continuação de PHY 007B. A Física 7C é mais parecida com o último trimestre ou semestre que, em cursos tradicionalmente ministrados, trata de óptica, eletricidade e magnetismo e física moderna.
Detalhes: Palestra - 1,5 hora (s) Discussão / Laboratório - 5 hora (s).

*O terceiro trimestre desta série é sugerido, mas não obrigatório

BIS 2A, 2B, 2C

BIS 2A Introdução à Biologia: Fundamentos da Vida na Terra
Descrição: Elementos essenciais da vida, incluindo fontes e uso de energia, armazenamento de informações, capacidade de resposta à seleção natural e celularidade. Origem da vida e influência dos seres vivos na química da Terra.
Detalhes: Palestra - 3 hora (s) Discussão - 2 hora (s).

Introdução à Biologia do BIS 2B: Princípios de Ecologia e Evolução
Descrição: Introdução aos princípios básicos da ecologia e biologia evolutiva, com foco nos mecanismos fundamentais que geram e mantêm a diversidade biológica em escalas que vão desde moléculas e genes a processos e padrões globais.
Detalhes: Palestra - 3 hora (s) Discussão - 1 hora (s) Laboratório - 3 hora (s).

BIS 2C Introdução à Biologia: Biodiversidade e a Árvore da Vida
Descrição: Introdução à diversidade orgânica, usando a árvore filogenética da vida como tema organizador. Palestras e laboratórios cobrem métodos de reconstrução filogenética, conhecimento atual da árvore da vida e a evolução das inovações mais importantes e interessantes da vida.
Detalhes: Palestra - 4 hora (s) Laboratório - 3 hora (s).

CHE 2A Química Geral
Descrição: Tabela periódica, estequiometria, equações químicas, propriedades físicas e teoria cinética dos gases, estrutura atómica e molecular e ligações químicas. Experimentos de laboratório em relações estequiométricas, propriedades e coleção de gases, espectroscopia atômica e análise quantitativa introdutória.
Detalhes: Palestra - 3 hora (s) Discussão / Laboratório - 4 hora (s).

CHE 2B Química Geral
Descrição: Fases condensadas e forças intermoleculares, termodinâmica química, equilíbrios químicos, ácidos e bases, solubilidade. Experimentos de laboratório em termoquímica, equilíbrio e análise quantitativa usando métodos volumétricos.
Detalhes: Palestra - 3 hora (s) Discussão / Laboratório - 4 hora (s).

CHE 2C Química Geral
Descrição: Cinética, eletroquímica, espectroscopia, estrutura e ligação em compostos de metais de transição, aplicação de princípios a reações químicas. Experimentos de laboratório em métodos analíticos selecionados e sínteses.
Detalhes: Palestra - 3 hora (s) Discussão / Laboratório - 4 hora (s).

CHE 8A Química Orgânica: Curso Breve
Descrição: Com CHE 008B, uma introdução à nomenclatura, estrutura, química e mecanismos de reação de compostos orgânicos. Destinado a alunos com especialização em outras áreas além da química orgânica.
Detalhes: Palestra - 2 hora (s).

CHE 8B Química Orgânica: Curso Breve
Descrição: Laboratório que se ocupa principalmente das técnicas laboratoriais orgânicas e da química das classes comuns de compostos orgânicos. Parte da aula uma continuação de CHE 008A.
Detalhes: Palestra - 3 hora (s) Laboratório - 3 hora (s).

CHE 118A Química Orgânica para Saúde e Ciências da Vida
Descrição: Apresentação rigorosa e aprofundada dos princípios básicos com ênfase em estereoquímica e espectroscopia e preparações e reações de hidrocarbonetos não aromáticos, haloalcanos, álcoois e éteres.
Detalhes: Palestra - 3 hora (s) Discussão / Laboratório - 1,5 hora (s).

CHE 118B Química Orgânica para Saúde e Ciências da Vida
Descrição: Continuação do CHE 118A, com ênfase na espectroscopia e na preparação e reações de hidrocarbonetos aromáticos, compostos organometálicos, aldeídos e cetonas.
Detalhes: Palestra - 3 hora (s) Laboratório - 3 hora (s).

CHE 118C Química Orgânica para Saúde e Ciências da Vida *
Descrição: Continuação do CHE 118B, com ênfase na preparação, reações e identificação de ácidos carboxílicos e seus derivados, alquil e acilaminas, compostos ß-dicarbonilados e várias classes de compostos biologicamente importantes de ocorrência natural.
Detalhes: Palestra - 3 hora (s) Laboratório - 3 hora (s).
*O terceiro trimestre desta série é sugerido, mas não obrigatório

CHE 128A Química Orgânica
Descrição: Introdução aos conceitos básicos de química orgânica com ênfase na estereoquímica e na química dos hidrocarbonetos. Projetado principalmente para graduados em química. Graduados em química devem se inscrever no CHE 129A simultaneamente.
Detalhes: Palestra - 3 hora (s).

Química Orgânica CHE 128B
Descrição: Continuação do CHE 128A com ênfase na química de álcoois, éteres, seus análogos de enxofre e compostos carbonílicos. Introdução à aplicação de métodos espectroscópicos à química orgânica. Introdução à síntese de moléculas orgânicas moderadamente complexas.
Detalhes: Palestra - 3 hora (s).

CHE 128C Organic Chemistry *
Descrição: Continuação de CHE 128B com ênfase em condensações de enolato e a química de aminas, fenóis e açúcares selecionados compostos biologicamente importantes.
Detalhes: Palestra - 3 hora (s).
*O terceiro trimestre desta série é sugerido, mas não obrigatório

ABI 102 Bioquímica Animal e Metabolismo
Descrição: Água e tampões biológicos termodinâmica da estrutura do metabolismo e função da cinética enzimática das biomoléculas e biologia da membrana da função digestão e absorção do metabolismo dos carboidratos.
Detalhes: Palestra - 4 hora (s) Discussão - 1 hora (s). Pré-requisito (s): (CHE 002A, CHE 002B, CHE 008A, CHE 008B) ou (CHE 118A, CHE 118B). Não está aberto para crédito para alunos que concluíram o BIS 102

ANS 100 Fisiologia Animal
Descrição: Princípios básicos da fisiologia animal em animais domesticados e cativos com uma abordagem comparativa. Aspectos moleculares, bioquímicos, químicos e físicos e suas influências no funcionamento dos sistemas fisiológicos dos animais.
Detalhes: Palestra - 4 hora (s) Discussão - 1 hora (s). Pré-requisito (s): BIS 002A CHE 002B. Passe Um restrito a alunos dos cursos de Zootecnia e Zootecnia e Gerenciamento.

Fisiologia Sistêmica NPB 101
Descrição: Fisiologia sistêmica com ênfase em aspectos da fisiologia humana. Funções dos principais sistemas de órgãos, com a estrutura desses sistemas descrita como base para a compreensão das funções.
Detalhes: Palestra - 5 hora (s). Pré-requisito (s): BIS 002A (CHE 002B ou CHE 002BH) PHY 001B ou PHY 007C fortemente recomendado.

NPB 110C Foundations 3: Fisiologia
Descrição: Concentra-se na estrutura, função e interações de sistemas de órgãos humanos e outros animais na homeostase e reprodução, e a resposta a perturbações da homeostase neural e endócrina sinalizando músculo esquelético e movimentos cardiovasculares e sistemas respiratórios renal, digestivo, imunológico e fisiologia reprodutiva.
Detalhes: Palestra - 4 hora (s) Discussão - 1 hora (s). Pré-requisito (s): NPB 110A C- ou melhor PHY 007A PHY 007B e PHY 007C recomendado. Aberto apenas para majores NPB declarados.


Cursos de método:

EDU 238 Introdução aos Métodos de Pesquisa-Ação Participativa (4)
GEO 200DN Geografia Analítica Socioespacial (4)
LDA 202 Métodos em Design e Pesquisa Paisagística (4)
NUT 258 Métodos de Pesquisa de Campo em Nutrição Internacional (3)
PLS 205 Experimental Design & amp Analysis (5)
PLS 206 Modelagem Multivariada Aplicada em Ciências Agrárias e Ambientais (4)
Métodos de pesquisa quantitativa SOC 207A (4)
Métodos Feministas WMS 200B (4)


Jonathan A. Eisen

Uma grande área de ênfase em meu laboratório está no estudo da ecologia, evolução e função de micróbios e comunidades microbianas. Nosso trabalho nesta área inclui tópicos como os listados abaixo:

  • A base genômica para a origem e evolução de novas funções.
  • A ecologia e evolução das comunidades microbianas.
  • A coevolução de micróbios e seus vasos portadores (isto é, hospedeiros).
  • Variação em “evolucionabilidade”.
  • O desenvolvimento de ferramentas computacionais baseadas na filogenia para analisar dados de sequência genômica e metagenômica.
Projetos de laboratório atuais e recentes (exemplos)
  • Microbiologia do ambiente construído. http://microbe.net. Meu laboratório está interessado na ecologia microbiana do "ambiente construído" - ou seja, os lugares que os humanos criaram, como edifícios, veículos, sistemas de água, etc. Fazemos pesquisas e atividades de comunicação nessa área.
  • Microbiomas de ervas marinhas.http://seagrassmicrobiome.wordpress.com. Um dos nossos principais tópicos de pesquisa é sobre as comunidades microbianas que vivem dentro e sobre as ervas marinhas e como elas contribuem para a evolução, ecologia e função dessas plantas importantes e seus ecossistemas circundantes.
  • Istmobiome. https://istmobiome.net. Estamos colaborando com o Smithsonian Tropical Research Institute para estudar microbiomas de organismos nos dois lados do istmo do Panamá.
Comunicação Científica e Acadêmica Aberta

Outro grande interesse do meu grupo é a comunicação científica e acadêmica. Estou profundamente comprometido com a abertura da comunicação acadêmica, melhorando o acesso à literatura, dados e ferramentas e também comunicando mais com o público fora da literatura acadêmica "normal" por meio de blogs, Twitter e outros meios.

Afiliações do UC Davis Graduate Group

  • Biologia Populacional
  • Microbiologia
  • Ecologia
  • Biofísica
  • Ciência da Computação
  • Genética Integrativa e Genômica

Cursos

Honras e prêmios

  • Prêmio UC Davis ADVANCE Scholar, 2019
  • Representante eleito para o Conselho AAAS, 2017-2020.
  • Presidente, Divisão R, American Society for Microbiology, 2010.
  • Eleito Fellow da American Academy of Microbiology, 2012
  • Revista Esquire, "Best and Brightest Innovators", 2002
  • Prêmio Walter J. Gores de Excelência em Ensino, 1998

Cargos anteriores e educação

  • 2000-2008. Docente Adjunto, Universidade John Hopkins, Departamento de Biologia.
  • 1998-2006. Docente, The Institute for Genomic Research, Rockville, MD.
  • 1991-1998. Universidade de Stanford. Aluno de Doutorado do Departamento de Ciências Biológicas do laboratório do Prof. Philip C. Hanawalt. Fez pesquisas sobre filogenômica dos processos de reparo do DNA. PhD em 1998.
  • 1986-1990. Harvard College. Conduziu pesquisas com a Prof. Colleen Cavanaugh em simbiontes quimiossintéticos e Fakhri Bazzaz em fisiologia vegetal. AB em Biologia 1990.

Publicações selecionadas. Consulte o Google Scholar para obter a lista completa.

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Ettinger C, Wilkins L, Dahlhausen K, Ghose S, Oberbauer D, Eisen JA, Coil D. 2018 Mesmo os super-heróis precisam de ajuda às vezes: três contos incríveis de simbiose microbiana. Frontiers in Young Minds 6: 50. doi: 10.3389 / frym.2018.00050

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Mukherjee S, Seshadri R, Varghese NJ, Eloe-Fadrosh EA, Meier-Kolthoff JP, Göker M, Coates RC, Hadjithomas M, Pavlopoulos GA, Paez-Espino D, Yoshikuni Y, Visel A, Whitman WB, Garrity GM, Eisen JA , Hugenholtz P, Pati A, Ivanova NN, Woyke T, Klenk HP, Kyrpides NC. 2017. 1.003 genomas de referência de isolados bacterianos e de archaea expandem a cobertura da árvore da vida. Nature Biotechnology 35: 676–683.

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Edwards J, Johnson C, Santos-Medellin C, Lurie E, Podishetty NK, Bhatnagar S, Eisen JA, Sundaresan V. 2015. Estrutura, variação e montagem dos microbiomas associados à raiz do arroz. Proceedings of the National Academy of Sciences USA 12: E911-20

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Castelle CJ, Hug LA, Wrighton KC, Thomas BC, Williams KH, Wu D, Tringe SG, Singer SW, Eisen JA, Banfield JF. 2013 Diversidade filogenética extraordinária e versatilidade metabólica em sedimentos de aquíferos . Nature Communications 4: 2120. doi: 10.1038 / ncomms3120. PMID: 23979677.

Rinke C, Schwientek P, Sczyrba A, Ivanova NN, Anderson IJ, Cheng JF, Darling A, Malfatti S, Swan BK, Gies EA, Dodsworth JA, Hedlund BP, Tsiamis G, Sievert SM, Liu WT, Eisen JA, Hallam SJ, Kyrpides NC, Stepanauskas R, Rubin EM, Hugenholtz P, Woyke T. 2013. Insights sobre a filogenia e o potencial de codificação da matéria escura microbiana . Nature 499 (7459): 431-7. doi: 10.1038 / nature12352.

Lang JM, Darling AE, Eisen JA. Phylogeny of Bacterial and Archaeal Genomes Using Conserved Genes: Supertrees and Supermatrices. PLoS ONE 8 (4): e62510. doi: 10.1371 / journal.pone.0062510.

Rands C, Darling AE, Fujita M, Kong L, Webster MT, Clabaut C, Emes RD, Heger A, Meader S, Hawkins MB, Eisen MB, Teiling C, Affourtit J, Boese B, Grant PR, Grant BR, Eisen JA, Abzhanov A, Ponting CP. 2013 Insights sobre a evolução dos tentilhões de Darwin a partir da análise comparativa da sequência do genoma de Geospiza magnirostris . BMC Genomics 2013, 14:95 doi: 10.1186 / 1471-2164-14-95.

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Funções / papéis biológicos das enzimas

As enzimas são vitais para todos os processos biológicos, auxiliando na digestão e no metabolismo. Além disso, estes também estão envolvidos em vários outros processos

  1. Enzimas como quinases e fosfatases são importantes para a regulação celular e transmissão de sinais.
  2. Diferentes enzimas são produzidas em todo o corpo para a regulação das reações envolvidas em várias vias metabólicas.
  3. A ativação e inibição de enzimas resultando em um mecanismo de feedback negativo ajustam a taxa de síntese de metabólitos intermediários de acordo com as demandas das células.
  4. Eles também catalisam modificações pós-tradução envolvendo fosforilação, glicosilação e clivagem da cadeia polipeptídica.
  5. Algumas enzimas também estão envolvidas na regulação dos níveis enzimáticos, alterando a taxa de degradação enzimática.
  6. Uma vez que uma regulação rígida das enzimas é essencial para a homeostase, qualquer mudança na estrutura e produção da enzima pode resultar em doenças.
  7. As enzimas sintetizadas em vários organismos também são utilizadas em várias indústrias para produção de vinho, produção de queijo, branqueamento de pão e desenho de tecidos.

Degradação de endocanabinoides

A degradação da anandamida no SNC é principalmente pela enzima amino hidrolase de ácido graxo (FAAH) (Fig. 2B) (65). Como o nome sugere, FAAH degrada várias amidas de ácidos graxos, incluindo palmitoil e oleoil etanolamida. Isso tem importantes implicações experimentais e terapêuticas, uma vez que a inibição de FAAH aumenta os níveis dessas etanolamidas, que têm ampla ação independente de receptores de canabinoides, por exemplo, (34, 38). Uma segunda via para a degradação da anandamida é a oxidação pela ciclooxigenase-2 (COX-2), para criar prostamidas (Fig. 2B) (66). Esses compostos têm ações biológicas distintas que são independentes dos receptores canabinoides, têm sua própria farmacologia única e têm um papel significativo como terapia para hipertensão intraocular (66, 67). As diferenças estruturais entre o ácido araquidônico e a anandamida são suficientes para permitir o desenvolvimento de inibidores da COX-2 que inibem a oxidação da anandamida sem afetar a formação de prostaglandinas (68). Além disso, a COX-2 é razoavelmente seletiva para anandamida em relação a outras acil etanolamidas, de modo que sua inibição oferece uma forma mais seletiva de aumentar a anandamida quando comparada à inibição de FAAH (69). Uma terceira via potencial de degradação da anandamida é via amidase ácida de hidrólise de N-aciletanolamina (NAAA) (Fig. 2B) (70). A inibição de FAAH pode desviar o metabolismo da anandamida para uma dessas vias alternativas, alterando as funções celulares que podem ser independentes do envolvimento do receptor canabinoide.

A degradação de 2-AG é principalmente devida a três enzimas hidrolíticas, monoacilglicerol lipase (MGL) e hidrolases de domínio alfa / beta 6 e 12 (ABHD6 e 12) (Fig. 2D) (71). Além disso, o 2-AG pode ser oxidado por COX-2 (69) e hidrolisado em algumas condições por FAAH. As três primeiras enzimas têm diferentes localizações subcelulares, que provavelmente definem a degradação de 2-AG em diferentes compartimentos celulares. O MGL é generalizado e, no sistema nervoso adulto, está localizado principalmente nos terminais sinápticos (72). Parece ser responsável pela maioria da hidrólise de 2-AG em uma ampla pesquisa da atividade hidrolítica de 2-AG no cérebro (71). Uma consequência da inibição de MGL é o aumento da sinalização de 2-AG em receptores CNS CB1, e. (73 & # x0201376), no entanto, também reduz os níveis disponíveis de ácido araquidônico, que é necessário para a síntese de prostaglandinas. Posteriormente, os processos inflamatórios mediados pela prostaglandina são diminuídos pela inibição do MGL (40). Em contraste com a localização pré-sináptica de MGL (17, 18), ABHD6 está localizado principalmente em dendritos e espinhas dendríticas de neurônios excitatórios no córtex (77). A inibição de ABHD6 também aumenta a sinalização de 2-AG por meio de receptores CB1 no SNC (77, 78). ABHD6 também tem funções significativas fora do SNC, por exemplo, (79, 80), o que complicará a aplicação de terapias baseadas em ABHD6 para distúrbios do SNC. ABHD12 é a outra enzima hidrolítica importante que se sugere estar envolvida na hidrólise de 2-AG no cérebro. Embora seu papel no metabolismo de 2-AG na Vivo não está firmemente estabelecido, ele desempenha um papel significativo na degradação de liso-fosfatidilserinas de cadeia longa (81). Curiosamente, em humanos, as mutações de perda de função de ABHD12 estão associadas à síndrome neurodegenerativa PHARC (82) e níveis aumentados de lisofosfatidilserina de cadeia longa (83). O metabolismo da COX-2 de 2-AG (Fig. 2D) no SNC é considerável, conforme evidenciado pelo aumento da sinalização de 2-AG por meio de receptores CB1 seguido pela inibição de COX-2 (84, 85). Curiosamente, um importante metabólito oxidativo de 2-AG, PGE2-glicerol éster (PGE2-GE), potencializa a transmissão sináptica, aumenta a plasticidade sináptica e produz hiperalgesia (86 & # x0201388). Como 2-AG agindo via CB1 receptores geralmente suprimem a transmissão sináptica e excitabilidade neuronal (veja abaixo) e PGE2-GE é excitatório, mudanças nos níveis de COX-2 ou atividade podem ter efeitos profundos na atividade da rede do SNC.


Resultados

Efeito da Genisteína no Isc

Quando banhado em solução normal de Krebs-Henseleit, o epitélio epididimal cultivado exibiu uma diferença de potencial transepitelial de 2,3 ± 0,1 mV (n = 118 monocamadas de 10 preparações de células diferentes), um Isc basal de 5,4 ± 0,2 μA / cm 2 (n = 118 monocamadas de 10 preparações de células diferentes) e uma resistência transepitelial de cerca de 500 Ω cm 2. Quando adicionada ao lado apical, a genisteína induziu um aumento dependente da dose em Isc (Fig. 1, B e C). No entanto, nenhuma mudança em Isc foi observada quando a genisteína foi adicionada ao lado basolateral (Fig. 1A). A resposta Isc máxima à genisteína foi de 6,25 ± 0,32 μA / cm 2 e a concentração efetiva média foi de 10 μM. Em todos os experimentos subsequentes, a genisteína foi adicionada ao lado apical do tecido.

Respostas Isc em 8 monocamadas epididimárias separadas, área 0,4 cm 2. UMA) Genisteína (20 μM) foi adicionada ao lado basolateral B) genisteína (20 μM) foi adicionada ao lado apical C) genisteína foi adicionada ao lado apical nas concentrações mostradas. As linhas horizontais indicam Isc zero. Cada registro é representativo de 4 experimentos diferentes. Detalhe: curva de resposta à concentração para genisteína. Cada ponto mostra a média ± SEM de 4 experimentos

Respostas Isc em 8 monocamadas epididimal separadas, área 0,4 cm 2. UMA) Genisteína (20 μM) foi adicionada ao lado basolateral B) genisteína (20 μM) foi adicionada ao lado apical C) genisteína foi adicionada ao lado apical nas concentrações mostradas.As linhas horizontais indicam Isc zero. Cada registro é representativo de 4 experimentos diferentes. Detalhe: curva de resposta à concentração para genisteína. Cada ponto mostra a média ± SEM de 4 experimentos

Efeito da substituição de íons

A Figura 2 mostra as curvas de resposta à concentração de genisteína quando os ânions nos meios de banho foram omitidos. Em solução livre de Cl - (HCO3 - solução), a dose limite e a resposta Isc máxima à genisteína foram de 10 μM e 1,53 μA / cm 2 (76% de inibição da resposta em solução normal de Krebs-Henseleit), respectivamente. Em HCO3 - solução livre (solução - Cl), a dose limite e a resposta máxima foram 1 μM e 3,41 μA / cm 2 (45% de inibição), respectivamente. A resposta Isc à genisteína quando ambos os ânions foram omitidos da solução de banho foi insignificante.

Curvas de concentração-resposta para genisteína em solução normal de Krebs-Henseleit (círculos sólidos), HCO3 - solução livre (quadrados), Cl - solução livre (triângulos) ou Cl - e HCO3 - Solução gratuita (círculos abertos). Cada ponto mostra a média ± SEM de 4 registros de quatro preparações de células diferentes

Curvas de concentração-resposta para genisteína em solução normal de Krebs-Henseleit (círculos sólidos), HCO3 - solução livre (quadrados), Cl - solução livre (triângulos) ou Cl - e HCO3 - Solução gratuita (círculos abertos). Cada ponto mostra a média ± SEM de 4 registros de quatro preparações de células diferentes

Envolvimento de Apical CFTR

Para investigar se a resposta Isc induzida por genisteína foi mediada pela ativação do canal Cl - apical ou dos transportadores colocados basolateralmente ou Na + -K + ATPase, o antibiótico formador de poros, nistatina (500 μM), foi usado para permeabilizar seletivamente a membrana basolateral. Soluções foram usadas para atingir um gradiente de Cl - de 40: 120 mM (apical a basolateral) através do epitélio após o mecanismo de transporte ativo ter sido desativado pela permeabilização da membrana basolateral. Conforme mostrado na Figura 3, uma resposta Isc à genisteína (5,00 ± 0,72 μA / cm 2) foi observada após o pré-tratamento com nistatina por 45–60 min. No platô da resposta, a adição basolateral de frusemida (100 μM), um inibidor do simporte Na + / K + / 2Cl -, não inibiu o Isc, confirmando que a membrana basolateral havia sido permeabilizada com sucesso pela nistatina. A aplicação apical de DPC (1 mM) bloqueou completamente a resposta Isc à genisteína, indicando o envolvimento do canal de Cl apical.

Resposta Isc induzida por genisteína obtida em epitélio permeabilizado basolateralmente. O tecido foi primeiro tratado com nistatina (500 μM) adicionada apicalmente por 45 min a 60 min. Em seguida, genisteína (20 μM) foi adicionada apicalmente seguida por frusemida (100 μM) adicionada basolateralmente e DPC (1 mM) adicionado apicalmente. O registro é representativo de 4 experimentos diferentes de 4 preparações de células diferentes

Resposta Isc induzida por genisteína obtida em epitélio permeabilizado basolateralmente. O tecido foi primeiro tratado com nistatina (500 μM) adicionada apicalmente por 45 min a 60 min. Em seguida, genisteína (20 μM) foi adicionada apicalmente seguida por frusemida (100 μM) adicionada basolateralmente e DPC (1 mM) adicionado apicalmente. O registro é representativo de 4 experimentos diferentes de 4 preparações de células diferentes

Os efeitos de diferentes bloqueadores dos canais de Cl foram examinados para investigar os tipos de canais de Cl ativados pela genisteína. Na fase de platô da resposta Isc à genisteína, DPC (1 mM) ou DIDS (100 μM) foi adicionado apicalmente para determinar se a resposta Isc à genisteína foi devido à ativação do canal ativado por cAMP (CFTR) ou Ca 2 + canal ativado. Como mostrado na Figura 4, DPC bloqueou completamente a resposta Isc à genisteína, enquanto DIDS, em uma concentração que deveria ter inibido o canal Cl - ativado por Ca 2+ no epidídimo [11], não exerceu qualquer efeito inibitório significativo.

Efeitos de DIDS e DPC em Isc induzido por genisteína. Genisteína (20 μM) adicionada apicalmente foi seguida por DIDS (100 μM) e DPC (1 mM) adicionado apicalmente. A linha horizontal indica Isc zero. O registro é representativo de 4 experimentos diferentes de 4 preparações de células diferentes

Efeitos de DIDS e DPC em Isc induzido por genisteína. Genisteína (20 μM) adicionada apicalmente foi seguida por DIDS (100 μM) e DPC (1 mM) adicionado apicalmente. A linha horizontal indica Isc zero. O registro é representativo de 4 experimentos diferentes de 4 preparações de células diferentes

Efeito da Thapsigargina no Isc Induzido por Genisteína

A Figura 5B mostra que o pré-tratamento com tapsigargina (1 μM), um inibidor microssomal de Ca 2+ -ATPase, induziu uma resposta Isc devido à liberação de Ca 2+ do armazenamento interno de cálcio. Quando a corrente voltou ao nível basal, a adição de genisteína produziu uma resposta Isc que não foi significativamente diferente daquela produzida pela mesma concentração de genisteína sem tratamento prévio com tapsigargina (Fig. 5A).

Efeito da tapsigargina na resposta Isc à genisteína. O tecido foi primeiro tratado com tapsigargina (1 μM) adicionado apicalmente seguido de genisteína (20 μM) adicionado apicalmente (B) A resposta de controle à genisteína é mostrada em UMA. A linha horizontal indica Isc zero. O registro é representativo de 4 experimentos diferentes de 4 preparações celulares diferentes

Efeito da tapsigargina na resposta Isc à genisteína. O tecido foi primeiro tratado com tapsigargina (1 μM) adicionado apicalmente seguido de genisteína (20 μM) adicionado apicalmente (B) A resposta de controle à genisteína é mostrada em UMA. A linha horizontal indica Isc zero. O registro é representativo de 4 experimentos diferentes de 4 preparações de células diferentes

Nível de AMP cíclico após genisteína

Os imunoensaios foram realizados para estudar os efeitos da genisteína no nível de cAMP intracelular no epitélio epididimal. Os resultados são mostrados na Figura 6. O conteúdo de cAMP intracelular sob condições basais e após incubação com genisteína (20 μM) foi de 47,6 ± 9,6 pmol / poço (n = 6) e 51,0 ± 15,0 pmol / poço (n = 5), respectivamente . A diferença não foi estatisticamente significativa. No entanto, a forscolina, servindo como um controle positivo, estimulou um aumento no nível de cAMP para 130,2 ± 14,4 pmol / poço (n = 5 P & lt 0,01).

Concentração de AMP cíclico em monocamadas de epidídimo de rato sob condição basal (controle) ou após estimulação com 20 μM de genisteína e 10 μM de forscolina. Cada coluna mostra a média ± SEM de 5-6 experimentos. ** P & lt 0,01 NS, nenhuma diferença significativa quando comparado ao controle

Concentração de AMP cíclico em monocamadas de epidídimo de rato sob condição basal (controle) ou após estimulação com 20 μM de genisteína e 10 μM de forscolina. Cada coluna mostra a média ± SEM de 5-6 experimentos. ** P & lt 0,01 NS, nenhuma diferença significativa quando comparado ao controle

Efeitos de inibidores de PKA, PKC e adenilato ciclase

Para elucidar ainda mais o envolvimento da via cAMP / PKA na resposta à genisteína, o efeito do inibidor de PKA, H-89, foi examinado. Conforme mostrado na Figura 7, a resposta Isc à genisteína pode ser completamente abolida após o pré-tratamento com H-89.

Efeito do H-89 na resposta Isc à genisteína. O tecido foi primeiro tratado com H-89 (20 μM) adicionado apicalmente seguido por genisteína (20 μM) adicionado apicalmente (B) A resposta de controle à genisteína é mostrada em UMA. A linha horizontal indica Isc zero. Cada registro é representativo de 4 experimentos diferentes

Efeito do H-89 na resposta Isc à genisteína. O tecido foi primeiro tratado com H-89 (20 μM) adicionado apicalmente seguido por genisteína (20 μM) adicionado apicalmente (B) A resposta de controle à genisteína é mostrada em UMA. A linha horizontal indica Isc zero. Cada registro é representativo de 4 experimentos diferentes

Outro conjunto de experimentos foi realizado para examinar o papel da fosforilação de CFTR por PKA na ação da genisteína. Após a permeabilização da membrana basolateral pela nistatina, a resposta Isc à genisteína pode ser bloqueada por pré-tratamento com MDL-12330A (50 μM), um inibidor de adenilato ciclase específico que teria esgotado o AMPc intracelular (Fig. 8B). No entanto, a adição subsequente de cAMP (5 μM), que teve muito pouco efeito sobre o Isc nesta concentração, restaurou totalmente a resposta do Isc à genisteína (Fig. 8, A e C).

Efeito de MDL-12330A na resposta Isc à genisteína. O tecido foi primeiro tratado com nistatina (500 μM) adicionada apicalmente por 45 min a 60 min e, em seguida, com MDL-12330A (50 μM) adicionado basolateralmente. Genisteína (20 μM) foi então adicionada apicalmente com (C) ou sem (B) reabastecimento com cAMP (5 μM). A resposta de controle à genisteína em epitélios permeabilizados basolateralmente é mostrada em UMA. As linhas horizontais indicam Isc zero. Cada registro é representativo de 4 experimentos diferentes

Efeito de MDL-12330A na resposta Isc à genisteína. O tecido foi primeiro tratado com nistatina (500 μM) adicionada apicalmente por 45 min a 60 min e, em seguida, com MDL-12330A (50 μM) adicionado basolateralmente. Genisteína (20 μM) foi então adicionada apicalmente com (C) ou sem (B) reabastecimento com cAMP (5 μM). A resposta de controle à genisteína em epitélios permeabilizados basolateralmente é mostrada em UMA. As linhas horizontais indicam Isc zero. Cada registro é representativo de 4 experimentos diferentes

Para estudar o envolvimento de PKC na resposta Isc à genisteína, o efeito do inibidor de PKC bisindolilmaleimida (BIS) foi examinado. Conforme mostrado na Figura 9, o pré-tratamento com BIS (1 μM) não afetou a resposta Isc à genisteína, mas reduziu a maior parte da resposta Isc ao ativador PKC, PMA (1 μM).

Efeito do BIS na resposta Isc à genisteína. O tecido foi primeiro tratado com BIS (1 μM) adicionado apicalmente e, em seguida, com genisteína (20 μM) e PMA (1 μM) adicionado apicalmente (B) A resposta de PMA foi acentuadamente atenuada pelo pré-tratamento com BIS. As respostas de controle à genisteína, PMA e ao veículo dimetilsulfóxido (DMSO) são mostradas em UMA. A linha horizontal indica Isc zero. Cada registro é representativo de 4 experimentos diferentes

Efeito do BIS na resposta Isc à genisteína. O tecido foi primeiro tratado com BIS (1 μM) adicionado apicalmente e, em seguida, com genisteína (20 μM) e PMA (1 μM) adicionado apicalmente (B) A resposta de PMA foi acentuadamente atenuada pelo pré-tratamento com BIS. As respostas de controle à genisteína, PMA e ao veículo dimetilsulfóxido (DMSO) são mostradas em UMA. A linha horizontal indica Isc zero. Cada registro é representativo de 4 experimentos diferentes

Efeitos da tirfostina A47 e da caliculina A

Como mostrado na Figura 10, a tirfostina A47 (20 ou 200 μM), em concentrações conhecidas por inibir a tirosina quinase, e caliculina A (20 ou 200 nM), em concentrações conhecidas por inibir a proteína fosfatase (PPase), não afetou o Isc basal no epitélio epididimal de rato, nem afetaram a resposta Isc à genisteína.

Efeitos da tirfostina A47 e caliculina A na resposta Isc à genisteína. UMA) Tirfostina A47 (20 μM ou 200 μM) adicionada apicalmente seguida por genisteína (20 μM) adicionada apicalmente. B) Caliculina A (20 nM ou 200 nM) adicionada apicalmente seguida por genisteína (20 μM) adicionada apicalmente. A linha horizontal indica Isc zero. Cada registro é representativo de 4 experimentos diferentes

Efeitos da tirfostina A47 e caliculina A na resposta Isc à genisteína. UMA) Tirfostina A47 (20 μM ou 200 μM) adicionada apicalmente seguida por genisteína (20 μM) adicionada apicalmente. B) Caliculina A (20 nM ou 200 nM) adicionada apicalmente seguida por genisteína (20 μM) adicionada apicalmente. A linha horizontal indica Isc zero. Cada registro é representativo de 4 experimentos diferentes


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Primeiro, vou me aprofundar nos recursos do IB Biology Topic. Vou separar os recursos em:

  • Referência rápida: Esses guias vêm principalmente do site IB Guides. Eles são resumos curtos das informações que geralmente incluem definições e diagramas. NOTA: Esses guias não foram atualizados desde antes das alterações do programa de 2016, portanto, certifique-se de manter o programa à mão enquanto os lê para não ficar louco tentando memorizar informações que você não precisa saber.
  • Notas mais longas: Essas notas mais longas vêm do site BioNinja. Eles fornecem uma visão mais aprofundada do material e você pode focar no tópico específico de seu interesse clicando nos tópicos listados no lado esquerdo da página.
  • Visão geral: O site IBWorld possui todas as notas para cada tópico em uma página da web. É um bom recurso especialmente para pessoas que desejam ser capazes de apenas ler muitas notas sem clicar em páginas diferentes para chegar a tópicos diferentes.
  • Apresentação de slides: Estas são apresentações do tipo PowerPoint sobre o material.
  • Vídeo: Vídeos de demonstração de como solucionar problemas relacionados ao material. Eles vêm de duas fontes diferentes, uma vez que nenhuma cobre todos os tópicos da Biologia IB.

Notas de rodapé

O material eletrônico suplementar está disponível online em https://dx.doi.org/10.6084/m9.figshare.c.3672997.

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