Em formação

Quando alguém decide se referir a um vírus como uma nova variante?


Eu li que o SARS-Cov-2 tem várias variantes, por exemplo:

Quando alguém decide se referir a um vírus como uma nova variante?


Minha pesquisa:

  • Eu olhei para / questions / tagged / variant? Tab = Votos
  • A questão O que determina quando um vírus se torna uma “nova cepa”? aborda tensão. A cepa é o mesmo que a variante?

Nós os usamos como sinônimos. No entanto, a variante é, a meu ver, mais coloquial do que científica. As cepas são frequentemente definidas na literatura por seu genoma distinto em comparação com outras cepas da mesma espécie (pode ser uma substituição de um par de bases ou mais). Em microbiologia, incluindo vírus, muitas vezes pensamos em uma cepa como a proliferação de uma única molécula distinta de DNA / RNA.

https://www.sciencelearn.org.nz/resources/184-virus-strains


Uma nova maneira de contar e identificar vírus rapidamente

Um professor da Lancaster University introduziu um novo conceito para analisar rapidamente a presença de um vírus de resfriados a coronavírus.

Com base na análise de elementos químicos, a metodologia, que foi adaptada de uma técnica analítica usada para identificar nanopartículas metálicas, é capaz de detectar a presença de vírus em apenas 20 segundos.

Embora os testes precisem ser realizados em um laboratório, eles podem ser usados ​​para identificar rapidamente se as pessoas internadas em hospitais foram infectadas por um vírus - permitindo que os médicos decidam os tratamentos e também admitam os pacientes em enfermarias de isolamento.

A técnica proposta, chamada de análise de 'espectroscopia de massa com plasma indutivamente acoplado de vírus único' (SV ICP-MS), pode ser usada para determinar rapidamente famílias de vírus. No entanto, embora o conceito possa identificar que alguém tem um tipo de coronavírus, por exemplo, ele não seria capaz de determinar o tipo de coronavírus ou variantes. Testes adicionais ainda seriam necessários para descobrir o vírus específico com o qual alguém foi infectado.

Embora o SV ICP-MS não seja uma alternativa para testes desenvolvidos para identificar especificamente os tipos de infecções por Covid-2, ele pode ser usado para discriminar se os vírus de uma família, como coronavírus, estão presentes ou não. Se for detectado a presença de um vírus, testes mais específicos serão necessários.

O conceito, desenvolvido pelo professor Claude Degueldre, do Departamento de Engenharia da Lancaster University, usa amostras diluídas de fluidos, como muco nasal ou saliva, de pacientes. Uma tocha de plasma é usada para atomizar e ionizar as partículas virais. Medidas de intensidades para massas selecionadas dos elementos dos vírus fornecem resultados rápidos para mostrar a presença de um vírus ou não. Este processo funciona em tipos de vírus DNA e RNA em segundos.

Análises complementares, como técnicas de sequenciamento existentes, podem ser testadas para completar a identificação, embora possam levar até dois dias.

Outro benefício importante é a capacidade de testar um grande número de amostras rapidamente.

O professor Degueldre disse: "O que estamos propondo aqui não é um novo teste Covid, mas um novo conceito para descobrir rapidamente se há vírus presentes. Isso seria útil se as pessoas estiverem doentes, mas não se sabe se elas têm um vírus ou outra condição de saúde que os está deixando doente. Este conceito informaria a equipe clínica se existe ou não um vírus para informar as ações de tratamento precoce e outras medidas, como a necessidade de isolamento. Ainda seriam necessários testes mais detalhados para descobrir o vírus exato infecção, mas os resultados demoram mais.

"Outra aplicação para o conceito é testar amostras de água de sistemas de esgoto ou caudal de rios. Os resultados permitiriam que especialistas em saúde pública identificassem áreas de cidades com surtos de vírus."

O conceito ainda está em um estágio inicial e mais pesquisas e experimentos são necessários para desenvolver o processo.


Como eles estão sendo rigorosamente estudados para segurança

As vacinas de vetores virais são seguras e eficazes.

As vacinas de vetores virais para COVID-19 estão sendo mantidas com os mesmos padrões rigorosos de segurança e eficácia [332 KB, 24 páginas] ícone externo de todos os outros tipos de vacinas nos Estados Unidos. As únicas vacinas COVID-19 que a Food and Drug Administration (FDA) dos EUA disponibilizará para uso nos Estados Unidos (por aprovação ou autorização de uso de emergência) são aquelas que atendem a esses padrões.


Por que os cientistas rastreiam as variantes?

Rastrear diferentes cepas ajuda os cientistas a descobrir se certas mutações alteram o funcionamento do vírus, diz Adalja. Algumas mutações virais podem afetar a melhor forma de tratamento, ele aponta, o que seria uma informação vital para uma doença mortal como o COVID-19.

No caso do SARS-CoV-2, os cientistas estão monitorando suas variantes em um esforço para entender como as mudanças genéticas no vírus podem afetar sua infecciosidade (e, portanto, sua disseminação), a gravidade da doença que causa, a melhor forma de tratamento , e a eficácia das vacinas disponíveis, diz o Dr. Russo.

Por exemplo, é por isso que você precisa tomar a vacina contra a gripe todos os anos. Os cientistas desenvolvem a vacina dependendo de quais cepas estão circulando mais amplamente para aquela temporada de gripe em particular.


Devo escolher um tipo de vacina em vez de outro?

Embora a eficácia geral das vacinas Moderna e Pfizer seja maior do que a vacina Johnson & amp Johnson, você não deve esperar até ter sua escolha de vacina - o que provavelmente está muito longe de qualquer maneira. A vacina Johnson & amp Johnson é quase tão boa quanto as vacinas baseadas em mRNA na prevenção de doenças graves, e isso é o que realmente importa.

A vacina Johnson & amp Johnson e outras vacinas de vetores virais, como a da AstraZeneca, são particularmente importantes para o esforço global de vacinação. Do ponto de vista da saúde pública, é importante ter várias vacinas COVID-19, e a vacina Johnson & amp Johnson é uma adição muito bem-vinda ao arsenal de vacinas. Não requer um freezer, o que torna muito mais fácil de enviar e armazenar. É uma vacina de dose única, tornando a logística muito mais fácil em comparação com a organização de duas doses por pessoa.

O maior número possível de pessoas precisa ser vacinado o mais rápido possível para limitar o desenvolvimento de novas variantes do coronavírus. A Johnson & amp Johnson deverá distribuir quase quatro milhões de doses assim que o FDA conceder a autorização de uso de emergência. Ter uma terceira vacina autorizada nos EUA será um grande passo para atender à demanda de vacinação e deter esta pandemia.

Nota do editor: Johnson & amp Johnson é um financiador da PBS NewsHour.

Este artigo foi republicado de The Conversation sob uma licença Creative Commons. Leia o artigo original.

Esquerda: Frascos de vacina candidata Janssen COVID-19 da Johnson & Johnson são vistos durante o ensaio de Fase 3 emsemble em uma fotografia sem data. Foto cedida pela Johnson & Johnson / Handout via Reuters


Existe alguma ligação entre os testes da vacina Oxford - realizados no Brasil e na África do Sul - e as novas variantes?

Pollard não pensa assim. Ele disse O BMJ, “O número de pessoas nos testes de vacinas é tão pequeno que é improvável que nossos esforços pressionem o vírus para levá-lo a selecionar novas variantes. A maioria dos ensaios clínicos tem apenas algumas centenas de pessoas vacinadas em cidades de centenas de milhares ou milhões de pessoas. Não acho que a vacinação tenha algo a ver com as novas variantes hoje. ”

Ele explicou, no entanto, que as variantes podem estar surgindo no Brasil e na África do Sul por causa da alta transmissão (cerca de 40-50% das pessoas infectadas) em populações que vivem em condições de superlotação. Pollard disse: “Nesses ambientes, as variantes do vírus que surgem e são capazes de se espalhar, apesar da imunidade pós-infecção existente, serão selecionadas. Se for esse o caso, não significa necessariamente que vamos nos encontrar em uma posição em que as vacinas não funcionam contra a hospitalização ou doenças graves, mas pode ser mais difícil prevenir doenças mais brandas e transmissão. Precisamos monitorar a situação cuidadosamente e trabalhar o processo que seria necessário para fazer uma vacina adequada, caso haja necessidade. ”


Vacinação contra as novas variantes: dados do mundo real

Definitivamente, não saímos da floresta pandêmica ainda, e nem este blog & # 8211, então vamos falar um pouco mais sobre anticorpos hoje, na esperança de que estejamos nos aproximando do momento em que eu (e todos nós ) pode ignorar a imunologia por um tempo.

Mas não estamos ignorando isso hoje! Há muitas notícias, muitas preocupações e muitas especulações sobre as formas variantes do coronavírus e o que isso significa para os programas de vacinação em andamento em todo o mundo. A resposta curta, felizmente, é que a proteção de anticorpos que você obtém com as vacinas atuais ainda parece sólida.

Como posso dizer isso, com tantas evidências de que os anticorpos diminuíram a afinidade com as proteínas da cepa variante? Aqui está uma nova pré-impressão que torna isso claro. Ele mostra a atividade de anticorpos neutralizantes em ensaios de pseudovírus contra as variantes britânica (B.1.1.7) e sul-africana (B.1.351), com dados versus um painel de anticorpos monoclonais, versus plasma convalescente de pacientes com coronavírus e versus plasma de pessoas que receberam as vacinas.

Primeiro, os monoclonais. A comparação de B.1.1.7 com 12 monoclonais diferentes mostrou que dez deles eram igualmente eficazes e dois outros mostraram apenas uma pequena diminuição na potência. A variante B.1.351, entretanto, era mais resistente. Cinco dos monoclonais tiveram sua atividade significativamente prejudicada, incluindo os Lilly e Regeneron que estão sendo usados ​​na clínica neste momento. B.1.351 parece evitar o monoclonal de Lilly imediatamente, embora o coquetel Regeneron de dois anticorpos ainda pareça eficaz como essa mistura. Isso significa que qualquer pessoa usando terapia de anticorpos monoclonais com os agentes atualmente disponíveis (e aqueles em desenvolvimento também, também testados neste trabalho) terá que ficar de olho em infecções B.1.351 e cepas relacionadas.

O mapeamento dessas mudanças de atividade versus mutações únicas mostrou que dois resíduos que são problemáticos são as mutações E484K e K417N. Esse tópico é abordado com mais detalhes neste novo artigo. Ele examina um mapa mutacional completo do domínio de ligação ao receptor da proteína Spike & # 8217s (RBD) e compara as atividades dos anticorpos Lilly e Regeneron. Eles detectaram ambas as mutações acima nas cepas variantes relatadas, bem como a sinalização de Y453F, que apareceu em algumas das variantes direcionadas ao vison na Europa. Eles também identificaram algumas mutações que escapam a um ou outro monoclonal que ainda não apareceu na natureza. Mapear tudo isso na estrutura RBD é instrutivo & # 8211 existem certamente alguns padrões que podem ser racionalizados, mas como os autores observam, ainda existem mutações nas principais áreas de ligação de RBD que não afetam nenhum dos anticorpos, e também existem mutações com efeitos muito perceptíveis que não estão em contato direto com nenhum dos anticorpos.

Mas, até agora, estamos falando apenas de monoclonais. Se você estiver infectado por tal coronavírus, ou se receber qualquer uma das vacinas atuais, você absolutamente não estará gerando uma resposta monoclonal sozinho. Não, o ponto principal de nosso sistema imunológico é que eles abordam o problema de um conjunto de direções diferentes ao mesmo tempo. E na parte de anticorpos dessa resposta, você fará uma lista muito longa de diferentes, que por sua vez serão gradualmente refinados e adaptados com o tempo. Portanto, vamos examinar a pré-impressão discutida acima e ver o que acontece com o plasma convalescente e o plasma de pacientes vacinados.

Verificando o plasma de 20 pacientes que se recuperaram do coronavírus no início deste ano, os autores descobriram que quatro deles não tiveram perda de potência contra B.1.17 ou B.1.351. 16 das amostras de plasma mostraram uma queda na potência contra B.1.351 e 11 amostras mostraram uma queda contra B.1.1.7. Essas quedas de atividade foram de 2,7 a 3,8 vezes no último caso e de 11 a 33 vezes contra o primeiro (mais sobre esses números daqui a pouco). A maior parte dessa queda B.1.351 parece ser atribuível à mutação E484K. Aqui está outra pré-impressão que acabou de sair olhando para a resposta do plasma convalescente à variante B.1.351 e outra intimamente relacionada, desta vez usando vírus vivo em vez de construções de pseudovírus. Eles também descobriram que os valores de IC50 são piores nos seis pacientes que examinaram (mais sobre isso abaixo!)

Agora, às amostras de plasma de pacientes vacinados, porque é isso que muitas pessoas estão realmente se perguntando: quão bem ser vacinado com os agentes atuais oferece proteção contra as novas variantes? Os autores estudaram o soro de 12 pacientes que receberam as duas doses da vacina Moderna e de 10 pacientes que receberam as duas doses da vacina Pfizer / BioNTech. A queda de atividade contra a variante B.1.1.7 foi de apenas cerca de 2 vezes em ambos os grupos, enquanto a queda de atividade geral contra a variante B.1.351 foi de 6,5 vezes em vacinados Pfizer e 8,6 vezes em vacinados Moderna.

OK, hora do mundo real. Em primeiro lugar, esses números nos dizem que ser vacinado fornece a uma pessoa mais proteção do que ser infectado pelo próprio coronavírus. Esse já era considerado o caso das formas mais comuns de coronavírus, mas é bom ver que ele também é transferido para essas duas novas variantes. Você vai ter proteção substancialmente melhor de ser vacinado, e você não precisa se arriscar com o curso imprevisível e potencialmente mortal de uma infecção real por coronavírus. Agora que temos vacinas, a ideia de permitir que o vírus simplesmente atravesse uma população para obter imunidade por essa rota parece mais obscena do que nunca. E não se engane, sempre foi uma ideia obscena para mim. Esses dados também indicam que as pessoas que já foram infectadas naturalmente e se recuperaram poderiam se beneficiar da vacinação, embora do ponto de vista da saúde pública possam estar muito mais atrasadas do que as pessoas que ainda não foram expostas.

E quanto a essas quedas de atividade, especialmente as maiores contra a variante B.1.351? Isso ainda deixa espaço para proteção? Aqui está a boa notícia: realmente é. Aqui está um gráfico do artigo que venho discutindo na maior parte deste post (via Eric Topol no Twitter, que é uma fonte sólida de informações sobre esse tipo de coisa), mostrando a atividade contra as duas novas variantes versus as boas # 8217 Variante D614G que todos estavam preocupados alguns meses atrás:

Conforme apontado pelo virologista Roberto Burioni esta manhã no Twitter, é importante prestar atenção ao eixo Y nesta escala logarítmica. A parte inferior do gráfico não é um ponto zero sem linha de atividade, a parte inferior ainda é um diluição cem vezes maior do soro dos pacientes. Você tem que fazer isso para obter uma janela de ensaio para ver as diferenças & # 8211 o soro direto de pacientes vacinados ainda deve martelar essas cepas virais. Como diz Burioni, & # 8220Há uma diminuição, mas a partir de níveis extremamente elevados. Eu acho que esses dados são muito bons& # 8220. E eu concordo. Seria muito interessante ver esse experimento sendo executado com plasma de pessoas que receberam apenas a primeira injeção de cada uma dessas vacinas, não seria?

O que devemos observar, então, são diminuições muito maiores do que os níveis de seis, 11 e 30 vezes. A pré-impressão da equipe sul-africana mencionada acima vale a pena ser considerada sob essa luz. É uma pequena amostra (seis pacientes) de plasma de pessoas que se recuperaram da & # 8220primeira onda & # 8221 coronavírus, observando como esses anticorpos lidam com os tipos B.1.351. Das seis, as atividades são 5,7 vezes menores, 9,6 vezes, 38,1 vezes, 53,2 vezes, 204 vezes e uma que foi um nocaute completo. Esses dois últimos preocupam, com certeza, principalmente o KO. Agora, você deseja ver uma amostra maior de pacientes, para saber o quão comuns são essas quedas grandes. E você deseja especialmente ver este experimento sendo executado em comparação ao plasma do paciente vacinado, conforme mostrado acima, o que deve ser melhor em todos os aspectos. Atualização: em resposta a algumas perguntas, sim & # 8211, uma coisa que os dados da África do Sul podem nos dizer é que haverá pessoas que passaram por uma série de infecções que estarão mais vulneráveis ​​à reinfecção com um dos novos variantes. Os títulos de anticorpos não são tudo, é claro, e sempre há a maturação clonal do anticorpo ao longo do tempo que está ajudando. Mas eu não gostaria de correr esse risco e não deveríamos correr o risco de ter essas variantes espalhadas tanto a ponto de descobrirmos.

O que os dados estão nos dizendo agora é que definitivamente parece que a vacinação ainda pode lidar com as formas variantes do coronavírus que estamos observando & # 8211, mas que também temos que estar alertas, porque não há nenhuma lei que diga isso esta proteção não pode ser violada. Tomar medidas de saúde pública para diminuir a disseminação das novas variantes é crítico, assim como vacinar o máximo de pessoas o mais rápido possível. Se bagunçarmos qualquer um deles, estaremos procurando por problemas sérios.

Mas há até mesmo uma saída potencial para esse problema, embora você odeie ter essa emergência e quebrar aquele vidro em particular. Como disse Moderna, os mRNAs variantes podem ser produzidos rapidamente para serem formulados como uma nova vacina. Juntar um com as mutações pontuais E484K e K417N (e outros) deve ser basicamente o mesmo processo que o & # 8217s foi usado para fazer os atualmente administrados (Moderna e Pfizer / BioNTech). Você levaria um golpe na produção, é claro, porque você & # 8217d teria que interromper os formulários atuais e iniciar os novos. E você estaria correndo um risco pequeno, mas real, de que eles tenham um desempenho diferente em eventos adversos (mas isso ainda seria semelhante à forma como lançamos diferentes vacinas contra a gripe a cada ano). Portanto, as tecnologias de mRNA nos oferecem um contra-ataque potencial, o que é bom & # 8211, mas vamos tentar não precisar usá-lo!


O H5N8 da gripe aviária e por que devemos prestar atenção

O Pintail do Norte, um pato migratório. Um deles transportou o vírus da gripe aviária de alta patogenicidade H5N8 para o Japão (Foto: Kohei Ogasawara).

Antes do COVID, relatos de uma nova gripe aviária gotejando ou até mesmo varrendo a Ásia não atraíam muita atenção. Isso certamente mudou. Então, quando dois membros da Equipe de Investigação e Investigação do Novel Coronavirus da China, coautores do primeiro aviso do que estava por vir em fevereiro de 2020 em O novo jornal inglês de medicina, soar um novo alarme, talvez devêssemos ouvir.

Em um curto Perspectiva de insights publicado em Ciência, & ldquoEmerging vírus da influenza aviária H5N8 & rdquo Weifeng Shi e George Gao argumentam que a gripe aviária agora em mais de 46 países na Europa, Ásia e África atingiu os humanos. Relatou-se que apenas sete trabalhadores de fazendas de aves na Rússia ficaram doentes, enquanto tentavam conter um surto entre seus animais de penas. Mas deve ter havido um tempo, no outono de 2019, em que COVID também adoeceu apenas algumas pessoas.

Um vírus da gripe aviária precisaria passar facilmente de pessoa para pessoa para espalhar uma pandemia em pessoas, como o SARS-CoV-2 faz. Isso é improvável, mas, como aprendemos, não é impossível.

Um vírus influenza tem uma superfície mais complexa do que os trigêmeos espinhosos do SARS-CoV-2. & ldquoH, & rdquo & ldquoN, & rdquo e os números são abreviações para descrever as superfícies das variedades da cepa A mais comum da gripe.

O vírus da gripe é enfeitado com dois tipos de glicoproteínas (proteínas com açúcares anexados). Um tipo, hemaglutinina (HA), vem em 16 variedades e muitos subtipos dentro dessas variedades (& ldquoclades & rdquo e & ldquosubclades & rdquo no léxico). A outra, uma neuraminidase (NA), possui nove tipos. Os HAs parecem espinhos, os NAs se assemelham a pirulitos.

A gripe espanhola de 1918 e a gripe suína de 2009 foram H1N1. Gripes de pássaros são H5. Milhares de epidemias de influenza que exterminaram as populações de pássaros foram documentadas desde 1878.

Os vírus da gripe se reinventam frequentemente, por meio de mutações pontuais que alteram uma base de RNA individual (& ldquodrift & rdquo), bem como por meio de eventos de recombinação rápida em larga escala que trocam segmentos gênicos (& ldquoshifts & rdquo). O SARS-CoV-2, em contraste, gera novas variantes com combinações de mutações pontuais e pequenas deleções, como duas bases de RNA.

Novas variantes virais são preocupantes porque podem alterar a transmissibilidade, a patogenicidade e a resposta imune do hospedeiro. Modificamos vacinas para acompanhar a mutação natural dos vírus.

Para cobrir várias bases, as vacinas contra a gripe consistem em dois tipos de influenza A e um tipo de influenza B. As vacinas convencionais contra a gripe se concentram em uma parte da hemaglutinina que o sistema imunológico reconhece como um estímulo para produzir anticorpos. Esforços para criar uma vacina mais universal contra a gripe estão em andamento desde a década de 1930. Os candidatos têm como alvo as partes compartilhadas que não mudam, como as hastes que suportam as hemaglutininas.

Shi e Gao apresentam uma árvore genealógica do vírus da gripe H5 atualmente varrendo grandes áreas do planeta e deduzem de onde ele veio. Os pesquisadores vislumbram a evolução viral comparando as sequências do genoma, limitadas, é claro, pelo que notamos.

O atual vírus da gripe aviária & ldquohighly pathogenic & rdquo & ndash HPAIV no jargão & ndash começou com uma variante do H5N1 atacando galinhas na Escócia em 1959. Uma cepa de H5N1 que matou gansos em Guangdong, China em 1996 se juntou e decolou, diversificando, especialmente desde 2010.

Em 2013, o vírus havia se transformado em H5N8 em Zhejiang, China, e depois apareceu na Rússia e em vários outros países europeus. Chegou ao Canadá no final de 2014, graças à migração de pássaros ao longo do Estreito de Bering naquele mês de agosto. Em seguida, o H5N8 surgiu novamente na Rússia, Mongólia, Europa, Índia e China. Enquanto isso, os vírus da gripe H5 emparelhados com N2, N3, N6 e N9 também apareceram em vários lugares.

Acompanhar a trajetória da gripe entre as aves migratórias no Japão revela o quão rápido a situação pode mudar.

Em outubro de 2020, pesquisadores da Universidade de Hokkaido relataram no jornal Vírus evidência de H5N8 em excrementos em um lago de aves migratórias. No final de março de 2021, mais de 30 novos surtos entre aves domésticas e aves selvagens haviam sido relatados no Japão, atribuídos a aves migratórias da Europa.

Aves doentes que voavam da Europa para o Japão eram incomuns por dois motivos: novas gripes geralmente vêm do Leste Asiático e tudo aconteceu em apenas alguns meses. Além disso, a variante europeia do H5N8 é um pouco diferente. Algumas das mutações de base única de RNA alteram os aminoácidos codificados de modo a fazer o vírus se ligar mais tenazmente aos receptores de ácido siálico nas células das vias aéreas inferiores humanas. Isso pode explicar por que, até agora, os vírus variantes não passam de pessoa para pessoa - enterrados profundamente nos pulmões, sendo menos propensos a expelir em uma tosse ou espirro. Mas a pessoa infectada sofre de problemas respiratórios graves.

Tomados em conjunto, fica claro que os novos vírus da gripe aviária estão por toda parte, vindos de um lugar para outro, talvez se misturando a novas variantes perigosas.

Mesmo se pudermos mapear todos os surtos, eles parecem agora ser contínuos e se espalhando, talvez preparando o cenário para uma pandemia caso eles se encontrem e se fundam em uma confluência assustadora. E com um vírus tão inerentemente mutável como a gripe, e tão mortal quanto as cepas de pássaros H5N8, poderia uma nova habilidade de passar de pessoa para pessoa semear outra pandemia? Desta vez de gripe?

Isso é o que Shi e Gao temem: & ldquoO potencial zoonótico dos AIVs garante monitoramento contínuo e vigilante para evitar mais transbordamentos que podem resultar em pandemias desastrosas. & rdquo

& ldquoDevido à migração de longa distância das aves selvagens, à capacidade inata de rearranjo dos vírus da gripe aviária, ao aumento da capacidade de ligação ao receptor do tipo humano e à constante variação antigênica dos HPAIVs, é imperativo que a disseminação global e o risco potencial do H5N8 os vírus da gripe aviária para a avicultura, a vida selvagem aviária e a saúde pública global não são ignorados. & rdquo

& bull Rev up vigilância dos vírus da gripe altamente patogênicos em granjas avícolas e em populações de aves selvagens
& bull Saiba mais sobre a transmissibilidade, patogenicidade e efeito na resposta imune humana de um subtipo específico de H5N8 (2.3.4.4b) e atualize as vacinas
& bull Diminuir a avicultura familiar em pequena escala e aumentar a agropecuária em grande escala, e administrar melhor os mercados de aves vivas
Evite pássaros selvagens, não cace ou coma-os e mantenha as medidas de saúde pública durante a temporada de gripe

Não guarde essas máscaras COVID ainda! E se vacinar, tanto contra o COVID quanto contra a gripe.


As variantes do Covid serão o próximo grande desafio. As vacinas podem nos proteger?

Todos os vírus sofrem mutação. Eles fazem isso para se adaptar e sobreviver melhor em seu hospedeiro específico. O vírus que causa o Covid-19 não é diferente: ele mudou do reino animal, onde provavelmente se originou nos morcegos, para o mundo humano. Desde então, os cientistas estão travando uma batalha entre a disseminação do vírus e a capacidade de imunização contra ele. Agora temos as vacinas para nos proteger contra Covid-19 - mas o que acontece quando esse vírus sofre mais mutações, como provavelmente acontecerá?

À medida que as restrições de bloqueio diminuem, o sul de Londres já viu um grupo de novos casos relacionados à variante sul-africana. Nos próximos seis meses, lidar com variantes emergentes será um dos maiores desafios que os cientistas enfrentam. Algumas vacinas mostram sinais promissores de lidar com novas variantes - as vacinas de mRNA fabricadas pela Pfizer e Moderna parecem oferecer alguma proteção contra as variantes identificadas pela primeira vez em Kent e na África do Sul. A maioria dos virologistas pensa que as vacinas Covid-19 protegerão contra doenças graves e morte, mesmo em pessoas que foram infectadas por uma cepa mutante do vírus.

Mas ainda existem dificuldades potenciais. Ser vacinado não impede necessariamente que você se torne assintomático infectado com Covid-19 e passe o vírus adiante. Além disso, algumas vacinas podem oferecer pouca ou nenhuma proteção contra pessoas infectadas por uma variante de Covid-19 e transmiti-la a outras (mas os especialistas acreditam que as vacinas, junto com a resposta imune natural do hospedeiro, ainda devem oferecer proteção residual suficiente para prevenir doenças graves doença e morte). Por exemplo, ensaios clínicos e estudos laboratoriais mostram que a vacina AstraZeneca é apenas cerca de 10% eficaz na proteção contra a variante sul-africana, mas os cientistas ainda acham que a vacina irá proteger contra doenças graves desta variante. Outra questão é por quanto tempo dura a imunidade à vacina e se as pessoas se tornam mais suscetíveis a diferentes variantes à medida que seus níveis de anticorpos caem com o tempo.

Os virologistas esperam que as vacinas induzam o que chamamos de imunidade anamnéstica de longo prazo. Essencialmente, isso significaria que, depois de ser vacinada, as células B e T de uma pessoa se lembrariam (possivelmente por toda a vida) das proteínas S específicas do vírus às quais foram expostas. Portanto, se a pessoa encontrasse o vírus novamente, seu sistema imunológico poderia responder rapidamente, produzindo células B ativadas (que produzem anticorpos) e células T (que matam as células infectadas pelo vírus) para combatê-lo.

O vírus que causa o Covid-19 pode produzir novas variantes de pelo menos duas maneiras diferentes. Em primeiro lugar, o vírus pode sofrer recombinação, que é o que acontece quando diferentes pedaços de genes de diferentes vírus infectam a mesma célula e se misturam para produzir novas variantes. Em segundo lugar, o vírus pode infectar um paciente imunocomprometido por um longo tempo e então evoluir dentro desse paciente para produzir uma nova variante. Esse processo evolutivo pode levar ao surgimento de uma nova variante que pode escapar das respostas imunológicas de seu hospedeiro, o que pode lhe dar certas vantagens quando se espalha para outras pessoas.

Então, como podemos combater novas variantes quando elas surgem? Algumas das vacinas Covid-19 de primeira geração, como as de mRNA, induzem uma faixa mais ampla de proteção do que outras. E já existem planos para atualizar as vacinas Pfizer, Moderna e AstraZeneca para corresponder mais de perto à variante sul-africana. Mas é praticamente e economicamente difícil atualizar continuamente cada vacina Covid-19 cada vez que uma nova variante aparece. Embora o redesenho da vacina tenha sido facilitado com a introdução de “plataformas de vacina”, ainda há um lapso de tempo significativo envolvido na fabricação de novas vacinas e na administração em massa às populações vulneráveis.

Uma opção é tratar a Covid-19 como tratamos a gripe sazonal. Todos os anos, os especialistas selecionam cuidadosamente uma vacina contra a gripe atualizada com base no que eles acham que se tornará a cepa dominante da gripe. Poderíamos aplicar este princípio às vacinas da Covid para cobrir o maior número possível de novas variantes. Este é o objetivo da rede de laboratórios da Organização Mundial de Saúde nos EUA, Reino Unido, China, Japão e Austrália, que trabalham juntos para identificar cepas emergentes do vírus da gripe.

Uma rede global de vigilância Covid-19 poderia operar da mesma maneira. Isso envolveria laboratórios de diagnóstico de hospitais de todo o mundo submetendo amostras clínicas a laboratórios que poderiam então comparar as diferentes sequências virais de diferentes hemisférios. Uma rede de vigilância determinaria quantas vacinas Covid precisariam ser projetadas, fabricadas e distribuídas para atingir as variantes emergentes. Uma nova vacina pode ser necessária anualmente ou a cada poucos anos, dependendo da rapidez com que as variantes surgem.

É claro que sempre há a possibilidade de uma variante do fim do mundo que escape de todas as vacinas existentes e da imunidade natural. Com a gripe, esse é um risco muito conhecido: os especialistas chamam de cepa “pandêmica”. Nos próximos anos, isso também pode ser um risco para o vírus que causa a Covid-19. Apenas vigilância, monitoramento e colaboração constantes ajudarão o mundo a detectar essa variante e evitar que uma pandemia catastrófica ocorra novamente.

Julian Tang é virologista clínico e professor associado honorário do departamento de ciências respiratórias da Universidade de Leicester


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CINGAPURA: Até 3 de maio, o Ministério da Saúde (MS) encontrou 29 casos locais de COVID-19 que estavam infectados com variantes de preocupação ou interesse.

Esses 29 casos locais têm variantes virais que foram detectadas pela primeira vez no Reino Unido, África do Sul, Brasil ou Índia.

Na terça-feira (4 de maio), o diretor de serviços médicos do MS, Kenneth Mak, disse que sete casos em três grupos locais têm uma das variantes detectadas pela primeira vez na Índia - o B16172. Isso inclui o cluster do Hospital Tan Tock Seng, que tinha 40 casos na terça-feira.

LEIA: 5 casos COVID-19 no agrupamento do Hospital Tan Tock Seng têm variante indiana de coronavírus

LEIA: Autoridades estudam a possibilidade de problemas de fluxo de ar e ventilação na enfermaria do Hospital Tan Tock Seng

Education Minister Lawrence Wong, who co-chairs the COVID-19 task force, said that while there were unlinked cases of COVID-19 before, these did not develop into clusters.

"The new variant strains have higher attack rates, they are more infectious, they are causing larger clusters than before," he said. "Due to the new variants, (the cases) are more infectious and larger clusters are forming."

Here's what we know so far about the new variants:

VARIANTS DETECTED IN SINGAPORE

Mr Wong noted at the task force press conference on Tuesday that the global COVID-19 situation had worsened, with new variants and cases spreading from South Asia to Southeast Asia.

MOH has listed the COVID-19 variants detected in local or imported coronavirus cases in Singapore, and six different strains were also found among local cases.

Ten local cases have one of two sub-variants from India. Seven have been infected with the B16172 variant, while three were found with the B16171 variant.

Eight local cases have the B1351 variant that was first found in South Africa.

New COVID-19 variants: Do the UK and South Africa virus strains pose a danger to Singapore?

The B117 or UK variant, which had been flagged earlier, was detected in seven cases and there were three cases of the P1 Brazilian strain of SARS-CoV-2.

LOCAL CLUSTERS WITH VARIANTS

A number of COVID-19 clusters that have formed in Singapore are tied to the coronavirus variants.

"Of note, seven cases in three of our local clusters have the B16172 or Indian variant," said Assoc Prof Mak on Tuesday.

Five of these cases are part of the cluster at Tan Tock Seng Hospital, one case is the immigration officer deployed at Changi Airport Terminal One and a case in the third cluster is a cleaner at a community care facility at Tuas South.

Professor Mak added that these viruses had been found to be "phylogenetically distinct", suggesting that the clusters were not linked.

"We have not completed the phylogenetic testing of all cases that we have and we're likely to see more viral variants identified over time," he said.

He added that the presence of these viral variants of concern affirmed Singapore's strategy to vaccinate all healthcare workers and prioritise vaccination for older Singaporeans.

"Had we not done so, the Tan Tock Seng cluster would have been significantly larger at this time," he said. "And the likelihood of that cluster getting out of control that much greater."

WHAT IS THE B1617 VARIANT?

The COVID-19 virus is constantly mutating, but the the World Health Organization (WHO) has a "watchlist" of the variants that pose a risk to public health.

The viral variant B1617, which was first seen in India, has been classified as one of seven "variants of interest" by WHO. These are variants that are being monitored as they show mutations that have epidemiological implications, such as the transmissibility or severity of the disease.

Assistant Professor October Sessions from the Saw Swee Hock School of Public Health said that as the virus spreads, the likelihood of new variants appearing increases and these will co-circulate until one gains a fitness advantage over the others.

"The majority of these variants will be neutral - they will not change the behaviour of the virus," he said.

Variants of concern, as opposed to variants of interest, must have an impact on diagnostics, treatments or vaccines, be more contagious or cause more severe disease. The UK, South African and Brazilian variants have been listed as variants of concern by WHO.

"Though this work is in progress, these criteria have not been characterised for the majority of variants that are rapidly evolving in India."

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Scientists are still studying whether the variant is driving an unexpected explosion in cases in India. WHO said in its Apr 27 update that preliminary modelling suggests it has "a higher growth rate than other circulating variants in India, suggesting potential increased transmissibility".

"It is often hard to tease out whether increased spread is due to relaxation of societal measures, decreased compliance or the virus itself," said Professor of Medicine at NUS Yong Loo Lin School of Medicine Dale Fisher.

"I think most of us believe that all these variants of concern are more transmissible because they have quite quickly become dominant and there are shared mutations."

KEY MUTATIONS IN THE B1617 VARIANT

There are three sub-strains of the B1617 variant - B16171, B16172 and B16173, and they share some characteristic mutations.

The variant has been called the "Bengal strain" as it was first detected in that region in India. It has also been called a triple mutant - although the variant contains a total of 13 spike protein mutations, there are three which are of concern.

All three mutations have been detected in other globally circulating variants and experts say they have evolved independently as the virus adapts to better infect humans.

One of the mutations, E484Q, which is very similar to the E484K mutation found in the South African and Brazilian variants, has been called the "escape mutation". This is because it appears to partially "escape" immunity from prior infection or vaccines.

Another mutation, L452R, was associated with large outbreaks in California and is estimated to be 20 per cent more transmissible than earlier waves of the virus. A third mutation, P681R, is also thought to make the virus more infectious.

Professor Fisher said that the variants have an increased capacity to bind: "It is like a lock and a key where the virus spike protein is the key and the receptors on the host cell are the lock. The mutations have a better key shape so it takes less virus to cause disease."

This means that precautions such as safe distancing, masks and hand hygiene have to be "done very well", he said.

"The measures still work but the new viruses are better at infecting so (they) will take advantage of small breaches that you may have gotten away with when the virus was the earlier strains."

Asst Prof Sessions added there have now been many documented cases of people shedding the virus beyond the 14-day mark.

"In response to this and the increased presence of more highly transmissible strains currently circulating in nearby countries, the stay-home notice has now been increased to 21 days to prevent the escape of the viruses into the community," he said.


Helpful Microorganisms

Some microorganisms are harmless and even helpful. A microorganism is only considered a pathogen if it causes disease. Harmless viruses, bacteria, fungi, protozoa, and parasites are simply called microorganisms.

Fungi. Fungi are important in nature. They help to break down dead organisms to make the nutrients accessible for new growth. The mushrooms that you eat are fungus, while bread is made with a fungus — yeast. One extremely helpful fungus — Penicillium notatum — helps us to make the antibiotic penicillin.

Protozoa. Some types of protozoa are useful to treat water or keep soil healthy.

Bacteria. Your gut contains helpful bacteria that keep you healthy and help you digest food. Having a healthy gut biome has even been linked to mental health and heart health. A balanced gut biome has also been linked to increased immune response, cancer prevention, and lower incidence of rheumatoid arthritis in early studies.

Vírus. Even viruses can be useful. Scientists now use viruses in gene therapy to treat certain conditions. They alter a virus so it is no longer harmful, and add whatever helpful DNA information will treat the condition. They then use the virus's natural ability to infect your cells and replicate to carry the helpful DNA into your body. This new DNA causes your cells to make a new protein, potentially helping a genetic condition. This treatment is still experimental but has been used in trials to treat cancer, heart disease, and more.

Fontes

abpi: "Fungi," "Parasites," "Protozoa."

BMC Biology: "Q&A: What are pathogens, and what have they done to and for us?"

CDC: "COVID-19 and Animals," "Frequent Questions About Hand Hygiene," "Zoonotic Diseases."

doenças: "Viral Vectors in Gene Therapy."

Harvard Health Publishing: "Can gut bacteria improve your health?"

heart.org: "How bacteria in your gut interact with the mind and body."

MedlinePlus: "How does gene therapy work?"

Minnesota Department of Health: "5 Common Ways Germs are Spread," "Causes and Symptoms of Waterborne Illness."


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