Em formação

Subpopulações de diferença genética vs taxa de movimento


Alguém me disse que se um geneticista não encontrar nenhuma diferença significativa entre 2 subpopulações que têm sobreposição espacial temporal, pode ser que elas ainda estejam quase fechadas (sem conexão). Isto está certo?

Posso deduzir algo sobre a taxa de câmbio individual entre as populações e a similaridade / diferença genética? Por exemplo, seriam necessários 5% dos indivíduos para mudar de população para mantê-los quase geneticamente idênticos. Isso difere entre as espécies (digamos peixes e mamíferos)?

Obrigado.

ps: qualquer referência a isso seria ótimo


[...] se um geneticista não encontrar nenhuma diferença significativa entre 2 subpopulações que têm sobreposição espacial temporal

Isso não está claro. Diferença de significância entre o quê? Qual hipótese estatística você está testando para qual não seria encontrada nenhuma diferença significativa (aceita a hipótese nula). Você talvez esteja pensando em um teste t para testar a diferença entre as características fenotípicas médias?

pode ser que ainda estejam quase fechados (sem conexão). Isto está certo?

Você quer dizer nenhum fluxo gênico (também conhecido como nenhuma migração)?

Posso deduzir algo sobre a taxa de câmbio individual entre as populações e a similaridade / diferença genética?

A "taxa de câmbio individual" é normalmente "denominada migração" ou "fluxo gênico".

De certa forma, sim, você pode. Mas a questão é muito ampla e difícil de responder no sentido geral. Vou apenas fornecer uma metodologia muito comum aqui.

Você pode calcular $ F_ {ST} $, uma estatística de divergência populacional. Um artigo muito bom explicando a matemática de $ F_ {ST} $ é Nei (1973). Eu recomendo calcular $ F_ {ST} $ seguindo Weir e Cockerham (1984). Então, se você pode assumir um modelo de ilha finito (taxa de migração igual $ m $ entre quaisquer duas populações) e um tamanho de população constante e conhecido $ N $, então

$$ F_ {St} = frac {1} {1 + 4N (m + mu) frac {d} {d-1}} $$

, onde $ d $ é o número de demes (número de ilhas). Esta equação pode ser encontrada em muitos lugares. Slatkin (1995) é um artigo muito bom, mas observe que sua solução final difere um pouco daquela que apresentei (por um termo quadrático) pelas razões explicadas em Charlesworth (1998). Você pode resolver para $ m $ e conectar $ F_ {ST} $ e $ N $ observados. Observe que, dependendo dos marcadores usados, $ mu $ será insignificante em comparação com $ m $.

Você pode querer dar uma olhada no post muito relacionado. Como alguém poderia calcular o fluxo gênico entre duas populações?