Em formação

Efeitos de nocaute não monotônicos em procariotos


Normalmente, ao realizar o nocaute do gene, os pesquisadores selecionam um gene para remover / substituir por lixo e, em seguida, ver se o procarioto ainda pode sofrer fissão. Se continuar a se reproduzir, o gene é rotulado como não essencial; se o organismo não consegue se reproduzir, o gene é rotulado como essencial; e às vezes (se o organismo pode se reproduzir, mas apenas por um certo número de gerações) o gene é rotulado como quase essencial.

Normalmente, se o gene X for essencial e você nocautear tanto o gene X quanto algum outro gene Y, o organismo ainda morre; este é um exemplo de comportamento monotônico. No entanto, nem sempre é esse o caso, pode ser que o gene X seja essencial apenas na presença do gene Y (por exemplo, se as duas proteínas produzidas estiverem em um delicado ciclo de feedback). Há exemplos em que o nocaute do gene X torna o organismo inviável, mas o nocaute do gene X e Y mantém a viabilidade? No caso mais extremo, Existe um exemplo em que ambos os genes X e Y são essenciais, mas se ambos forem eliminados, o organismo ainda é viável? Estou principalmente interessado em procariontes simples (uma resposta para Mycoplasma genitalium ou Escherichia coli seria melhor), mas organismos mais complicados são preferidos a nenhuma resposta.


Aqui está um exemplo em que o nocaute de um gene não essencial na levedura (Saccharomyces cerevisiae) suprime os efeitos letais de um nocaute diferente.

Amy L. Kistler e Christine Guthrie (2001) A deleção de MUD2, o homólogo de levedura de U2AF65, pode contornar o requisito de Sub2, uma ATPase spliceossômica essencial. Genes & Development 15: 42-49

O gene SUB2 codifica uma proteína que é um componente do complexo TREX necessário para a exportação de mRNA nuclear. A exclusão do gene SUB2 é letal. O gene MUD2 codifica uma proteína não essencial envolvida no splicing pré-mRNA.

Os autores mostram que -

"... o requisito essencial para a SUB2 ATPase pode ser contornado pela exclusão do fator de splicing não essencial MUD2 ..."

Informações detalhadas sobre esses (e todos os outros) genes de Saccharomyces cerevisiae estão disponíveis gratuitamente no banco de dados do genoma de Saccharomyces